Xây dựng mô hình 2D-Qsar sàng lọc các chất kháng Hemozoin

Các tác giả

  • Kim Ngọc Sơn lhu.edu.vn
  • Nguyễn Thị Tuyết Hà
  • Hà Thị Phương Linh
  • Đỗ Thành Trung
  • Huỳnh Hiếu Nghĩa

DOI:

https://doi.org/10.61591/jslhu.18.290

Từ khóa:

Kháng sốt rét; Kháng hemozoin; In silico; 2D-QSAR.

Tóm tắt

Tập dữ liệu 592 chất, trong đó: 132 dẫn chất của quinolin, 75 dẫn chất của benzimidazol và 100 chất từ thư viện đại học Tokyo được sử dụng để xây dựng mô hình 2D-QSAR bằng phần mềm MOE 2014.09 sử dụng thuật toán bình phương tối thiểu từng phần. Kết quả xây dựng được 3 mô hình 2D-QSAR với các giá trị R2, Q2, RMSE, CCC lần lượt là 0,79; 0,76; 0,20; 0,88 cho mô hình QSAR dẫn chất quinolin (1); 0,79; 0,73; 0,10; 0,88 cho mô hình QSAR dẫn chất benzimidazol (2) và 0,79; 0,76; 0,13; 0,88 cho mô hình QSAR các chất từ thư viện đại học Tokyo (3). Kết quả sàng lọc ảo trong tập dược liệu cổ truyền Trung Hoa cho thấy mô hình (1) có 228 chất (IC50 ≤ 10 µM), mô hình (2) có 5252 chất (IC50 ≤ 10 µM), mô hình (3) có 313 chất (IC50 ≤ 15 µM) có hoạt tính kháng hemozoin tốt.

Tài liệu tham khảo

Marsh, Kevin, et al. "Development of WHO recommendations for the final phase of elimination and prevention of re-establishment of malaria." The American Journal of Tropical Medicine and Hygiene 110.4 Suppl (2024): 3.

DOI: https://doi.org/10.4269/ajtmh.22-0768

Gerth-Guyette, Emily, et al. "Assessing the operational feasibility of integrating point-of-care G6PD testing into Plasmodium vivax malaria management in Vietnam." Pathogens 12.5 (2023): 689.

DOI: https://doi.org/10.3390/pathogens12050689

Quang, Huynh Hong, et al. "Multidrug-resistant Plasmodium falciparum parasites in the Central Highlands of Vietnam jeopardize malaria control and elimination strategies." Antimicrobial Agents and Chemotherapy 65.4 (2021): 10-1128.

DOI: https://doi.org/10.1128/aac.01639-20

Pandey, Amit V., et al. "Mechanism of malarial haem detoxification inhibition by chloroquine." Biochemical Journal 355.2 (2001): 333-338.

DOI: https://doi.org/10.1042/bj3550333

Mosaddeque, Farhana, et al. "Prediction model for antimalarial activities of hemozoin inhibitors by using physicochemical properties." Antimicrobial Agents and Chemotherapy 62.5 (2018): 10-1128.

DOI: https://doi.org/10.1128/aac.02424-17

Sharma, Bharvi, et al. "Quinoline‐based heterocyclic hydrazones: Design, synthesis, anti‐plasmodial assessment, and mechanistic insights." Chemical Biology & Drug Design 101.4 (2023): 829-836.

DOI: https://doi.org/10.1111/cbdd.14185

Chen, Calvin Yu-Chian. TCM Database@ Taiwan: the world's largest traditional Chinese medicine database for drug screening in silico. PloS one, 2011, 6.1: e15939.

DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0015939

Vijayaraghavan, Shilpa, and Supriya Mahajan. "Docking, synthesis and antimalarial activity of novel 4-anilinoquinoline derivatives." Bioorganic & medicinal chemistry letters 27.8 (2017): 1693-1697.

DOI: https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2017.03.005

Andayi, Warren Andrew, Timothy J. Egan, and Kelly Chibale. "Kojic acid derived hydroxypyridinone–chloroquine hybrids: Synthesis, crystal structure, antiplasmodial activity and β-haematin inhibition." Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 24.15 (2014): 3263-3267.

DOI: https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2014.06.012

Andayi, Warren A., et al. "Synthesis, antiplasmodial activity, and β-hematin inhibition of hydroxypyridone–chloroquine hybrids." ACS medicinal chemistry letters 4.7 (2013): 642-646.

DOI: https://doi.org/10.1021/ml4001084

Fong, Kim Y., Rebecca D. Sandlin, and David W. Wright. "Identification of β-hematin inhibitors in the MMV Malaria Box." International Journal for Parasitology: Drugs and Drug Resistance 5.3 (2015): 84-91.

DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijpddr.2015.05.003

Saify, Zafar Saied, et al. "New benzimidazole derivatives as antiplasmodial agents and plasmepsin inhibitors: synthesis and analysis of structure–activity relationships." Bioorganic & medicinal chemistry letters 22.2 (2012): 1282-1286.

DOI: https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2011.10.018

Sandlin, Rebecca D., et al. "Identification of β-hematin inhibitors in a high-throughput screening effort reveals scaffolds with in vitro antimalarial activity." International Journal for Parasitology: Drugs and Drug Resistance 4.3 (2014): 316-325.

DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijpddr.2014.08.002

Wicht, Kathryn J., et al. "Identification and SAR evaluation of hemozoin-inhibiting benzamides active against Plasmodium falciparum." Journal of medicinal chemistry 59.13

(2016): 6512-6530.

DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.6b00719

https://www.chemcomp.com/

Chao, Wen-Wan, and Bi-Fong Lin. "Bioactivities of major constituents isolated from Angelica sinensis (Danggui)." Chinese medicine 6.1 (2011): 1-7.

DOI: https://doi.org/10.1186/1749-8546-6-29

Irungu, Beatrice N., et al. "Antiplasmodial and cytotoxic activities of the constituents of Turraea robusta and Turraea nilotica." Journal of ethnopharmacology 174 (2015): 419-425.

DOI: https://doi.org/10.1016/j.jep.2015.08.039

Tải xuống

Đã Xuất bản

10-05-2025

Cách trích dẫn

Kim Ngọc Sơn, Nguyễn Thị Tuyết Hà, Hà Thị Phương Linh, Đỗ Thành Trung, & Huỳnh Hiếu Nghĩa. (2025). Xây dựng mô hình 2D-Qsar sàng lọc các chất kháng Hemozoin. Tạp Chí Khoa học Lạc Hồng, 1(18), 80–88. https://doi.org/10.61591/jslhu.18.290